داستان فیلم تبدیل شوندگان 5 از آنجا آغاز می شود که آنیکرون (انیکرون)، دشمن دیرینه آتوبات ها بار دیگر بازگشته است ولی این بار موضوع متفاوت است؛ هم قدرت آنها بیشر شده و هم پیروزی بر آنها محال به نظر می رسد. آنیکرون دستور دارد تا آتوبات ها را دستگیر و هر چه سریعتر آنها را به سیاره شان منتقل کند. دلیل این کار شورشی شناخته شدن آتوبات ها است. هم چنین آپتیموس سیاره اش سایبترون را یافته اما به مکانی مرده تبدیل شده است. در ادامه باید دید که آیا آتوبات ها می توانند همانند نسخه قبل ،که از شر هسته ای مخرب و ویران گر خلاص شده بودند، این بار نیز بر دشمن خود غلبه کنند ...